Das Institut für Medizinische Mikrobiologie und Virologie für die gesamte Infektionsdiagnostik in der Krankenversorgung der UMG und zahlreicher externer Kliniken zuständig. Je nach Fragestellung kommen sowohl klassische Methoden des direkten Erregernachweises (Mikroskopie und Kultur) und der phänotypischen Resistenztestung, als auch sehr moderne molekularbiologische Nachweismethoden zum Einsatz. Für gezielte Untersuchungen an Risikoorganismen steht am Institut für Medizinische Mikrobiologie und Virologie gemäß Biostoffverordnung auch ein S3-Labor (z. B. Tuberkulose) am Messtandort Kreuzbergring 57 zur Verfügung. Darüber hinaus werden serologische Methoden des Antikörper- und Antigennachweises durchgeführt.

Aufgrund der Expertise der Mitarbeiter werden regelmäßig neue Testverfahren entwickelt bzw. bestehende optimiert. Damit verbunden hat das Institut für Medizinsche Mikrobiologie internationale und nationale Anerkennung erhalten und ist zurzeit ein vom Robert-Koch-Institut ernanntes Konsiliar- bzw. Expertenlabor für die Toxoplasmosediagnostik.
Regelmäßig durchgeführte Infektionsvisiten, ein Antibiotic Stewardship (ABS)-Team und tägliche persönliche telefonische Beratung sollen eine noch engere infektiologisch-mikrobiologische Betreuung der Universitätskliniken und externer Krankenhäuser gewährleisten und zur Begrenzung nosokomialer Infektionen beitragen.